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鄂尔多斯肖斌博士所在团队发现治疗新冠肺炎的潜在活性小分子!
2020/2/21| 鄂尔多斯新闻网 览1232次


▲内蒙古细胞生物学会官网截图


      近日,鄂尔多斯市中心医院肖斌博士与北京中日友好医院张维库研究员组成联合研究小组,基于传统中医药“以毒攻毒”理念,利用计算机辅助药物设计等技术手段,开展了从有毒中药瑞香狼毒中筛选抗SARS-CoV-2(新型冠状病毒)药物的研究工作,并获得了2个潜在高活性的小分子。

瑞香狼毒(断肠草,蒙药名:达楞图如)始载于《神农本草经》,主产于我国内蒙古、黑龙江、甘肃、青海等地。其味辛,性平,有毒,归肝、脾经;主咳逆上气,破积聚饮食、寒热水气,具有逐水祛痰、破积杀虫之功效。近年来的研究显示,其提取物及所含化学成分具有抗病毒活性(其中若干化合物具有较强的抗HIV活性以及较低的细胞毒性,EC90<1 nM)。
肖斌、张维库等人综合运用计算机辅助药物设计等技术手段,对瑞香狼毒中的百余个小分子化合物进行了研究工作。鉴于Mpro蛋白表面多空腔的特点,除与6LU7中小分子配体Mpro_B进行对比外,研究小组采用了全覆盖靶点蛋白(global grid box)的搜索策略,从中筛选出2个与Mpro靶点亲和力强且策略方法重现性高的双黄酮化合物狼毒素(Chamaejasmin)和异狼毒素(Isochamaejasmin),这2个化合物靶点亲和力均大于瑞德西韦、利托那韦(Ritonavir)、更昔洛韦(Ganciclovir)、利巴韦林(Ribavirin)、氯喹(Chloroquine)、达芦那韦(Darunavir)、阿巴卡韦(Abacavir)等已知药物,且均能有效占据已知的Mpro蛋白结合位点并形成若干重要的氢键结合。
该研究为瑞香狼毒中天然产物的生物活性研究拓展了方向,可考虑将其纳入抗SARS-CoV-2(新型冠状病毒)体内外活性筛选中。
目前,联合研究小组正在基于SARS-CoV-2(新型冠状病毒)相关靶点寻找更多可能的潜在药物分子,也将针对与Mpro靶点蛋白亲和力较强的狼毒中天然产物继续进行深入的抗SARS-CoV-2(新型冠状病毒)体内外活性测试,以期为抗新冠肺炎药物的发现和开发提供更多信息。


亲和力最高的结合构象
↑①狼毒素,与氨基酸残基THR-26、TYR-54、LEU-141形成3个氢键结合

↑②异狼毒素,与氨基酸残基SER-144、CYS-145、GLY-143、LEU-141、GLU-166形成5个氢键结合

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▲肖斌


肖斌,2007年9月至2013年就读于沈阳药科大学,获生药学博士学位;2009年8月至2013年1月在釜山大学留学,并从事博士课题研究;2013年8月至今,就职于鄂尔多斯市中心医院药剂科临床药学实验室。多年来主要从事药物化学、药理学、分子对接等方面的药学研究。


担任内蒙古细胞生物学会理事、鄂尔多斯市博士创新协会常务理事、鄂尔多斯市药品学会理事。

 
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